Archive for July 2012

遺伝情報データベース

Posted by: kyanobi

  1. CATchUP (2016年9月公開) 時空間特異的な発現様式を示す遺伝子情報データベース (Ref. Nakamura et al. in press)
  2. PlantExpress (2016年7月公開) イネ、シロイムナズナの遺伝子発現ネットワーク情報データベース (Ref. Kudo et al. in press)
  3. Pleurochrysome (2015年8月公開) 円石藻ESTに関する配列・生物学的機能・オーソログ情報を提供するデータベース (Ref. Yamamoto et al., 2016)
  4. Arabidopsis TAC Position Viewer (2015年4月公開) シロイヌナズナ, TAC (Genomic transformation-competent artificial chromosome) クローンの染色体位置情報を提供するゲノムブラウザ (Ref. Hirose et al., 2015)
  5. Lygodium japonicum Transcriptome Database (2014年5月公開) (Ref. Aya et al., 2015)
  6. PODC (2013年10月公開) 植物の遺伝子発現ネットワーク情報を提供するデータベース, 植物種間のネットワーク比較が可能 (Ref. Ohyanagi et al., 2015)
  7. TOMATOMICS (2011年11月公開) TOMATOMICS (New Version : β Version) (2015年8月公開) 国内外からの総アクセス数 約20万件 (2013年7月現在) トマトのゲノム, トランスクリプトーム, メタボローム, Gene Ontology, 遺伝子発現ネットワーク等のオミックス情報及びゲノムブラウザーを提供するデータベース
  8. JADB (2012年5月公開) 国内外からの総アクセス 約2000件 (2013年7月現在) ウメ (Prunus mume Sieb. et Zucc.) のESTデータベース (Ref. Habu et al., 2011)
  9. OsMES (2011年6月公開) 国内外からの総アクセス数 約1250万件 (2013年7月現在) イネのミトコンドリア・ゲノムの遺伝子発現情報 (Ref. Fujii et al., 2011)
  10. DAGViz (2009年4月公開) 国内外からの総アクセス数 約5万件 (2013年7月現在) Gene OntologyのDAGを表示するWebツール (Ref. Yano et al., 2009)
  11. OryzaExpress (2008年3月公開) 国内外からの総アクセス数 約100万件 (2013年7月現在) イネの遺伝子機能アノテーション, マイクロアレイ・プラットフォーム, 遺伝子共発現解析結果などのデータベース (Ref. Hamada et al., 2011)
  12. KaFTom (2006年12月公開) 国内外からの総アクセス数 約70万件 (2013年7月現在) トマト完全長cNDAクローンのESTおよび全長配列, および, それらの機能アノテーション (Ref. Aoki et al., 2010)
  13. MiBASE old version / new version (2005年1月公開) 国内外からの総アクセス数 約300万件 (2013年7月現在) トマト矮性品種Micro-TomのEST, トマトUnigene, カスタム・マクロアレイ, 代謝パスウェイ, 機能アノテーション, GO (Ref. Yano et al., 2006)
  14. KATANA (2005年1月公開) 国内外からの総アクセス数 約100万件 (2013年7月現在) シロイヌナズナの代謝パスウェイ, 遺伝子のアノテーションとGO, 遺伝子産物の統合検索データベース (Ref. Yano et al., 2005)